Los patógenos transmitidos por la sangre se identifican rápidamente disolviendo su ADN.

Los patógenos transmitidos por la sangre se identifican rápidamente disolviendo su ADN.

Una nueva técnica que implica disolver el ADN de las bacterias encontradas en muestras de sangre puede diagnosticar infecciones potencialmente mortales más rápido que nunca. Los resultados se pueden obtener en cuestión de horas en lugar de días.

Por lo general, para ver si alguien tiene bacterias dañinas en el torrente sanguíneo, se coloca una muestra de sangre en un medio de crecimiento en una placa de Petri. Si las bacterias están realmente en la sangre, seguirán creciendo. Sin embargo, pueden pasar desde 15 horas hasta varios días antes de que crezcan a niveles detectables.

Profe. Dirigidos por Stephanie Frawley, los científicos de la Universidad de California en San Diego están explorando una alternativa más rápida y precisa.

Desarrollaron un chip de microfluidos en el que se recoge una pequeña muestra de sangre y luego se calienta a una temperatura de 50 a 90 ºC (122 a 194 ºF). Si hay bacterias en el líquido, el calor hace que sus moléculas de ADN se disuelvan. A medida que esas moléculas se desintegran, sus hebras de doble hélice se deshacen en un patrón revelador característico de una secuencia de nucleótidos.

Para garantizar ese patrón, se agrega un tinte especial al patrón. Esto conduce a un proceso de desenrollado para producir luz fluorescente. Al analizar las características de De esa luz se obtiene una firma conocida como curva de fusión. Luego, esa curva de fusión se compara con otras que ya se sabe que son bacterias específicas.

Una vez que se encuentra una coincidencia, la bacteria se identifica en la muestra de sangre. Todo el proceso no lleva más de seis horas. Este tipo de velocidad no sería posible si no fuera por el uso de algoritmos personalizados de aprendizaje automático que identifican y descartan la curva de fusión del ADN del propio paciente, así como otros «ruidos de fondo».

Una mirada más cercana a un chip de microfluidos
Una mirada más cercana a un chip de microfluidos

David Bilot/Escuela de Ingeniería Jacobs de UC San Diego

Para probar la tecnología, se analizaron muestras de sangre de 17 niños sospechosos de sufrir infecciones por sepsis potencialmente mortales. La nueva técnica no coincidió exactamente con los resultados obtenidos con los métodos convencionales, que no produjeron falsos positivos. Este no siempre es el caso con otros métodos como la amplificación de ácidos nucleicos, que simplemente amplifican la firma de todo el ADN.

«Esta es la primera vez que este método se prueba en sangre total de pacientes sospechosos de tener sepsis», dijo Frawley. «Así que este estudio es una vista previa más realista de cómo funcionará la tecnología en situaciones clínicas reales».

Recientemente se publicó un artículo sobre la investigación. La revista de diagnóstico molecular.

Fuente: Universidad de California San Diego

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